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• 消化系统相关遗传病

消化系统相关遗传病概述

消化系统疾病有相当一部分具有显著的遗传性特征,并在家族中具有遗传倾向。诸如炎症性肠病、遗传性肝病、胆汁淤积症、先天性腹泻等临床相对常见疾病,因临床致病因素多样,包括解剖异常,菌群失调或其他疾病应激性反应而往往忽略遗传因素,遗传异质性的存在也给疾病的基因诊断带来挑战。

虽然在许多遗传性疾病中可见慢性肝损害,但以肝脏作为主要靶器官的遗传性疾病最常见的为胆汁淤积症、高胆红素血症等。



 1.胆汁淤积症(cholestasis)是指肝内外各种原因造成胆汁形成、分泌和排泄障碍,胆汁不能正常流入十二指肠而进入血液的病理状态,是婴儿期肝脏疾病最常见的表现之一,在2500-5000名活产婴儿中约有1人患有该病。

 2.高胆红素血症是儿科特别是新生儿科的常见疾病,足月儿发生率约为60%,经过光疗后大多可以治愈,严重黄疸是重要的临床征象,常提示不同病因的严重肝胆疾病,若不及时得到确诊及正确治疗,可能引起胆红素脑病,对神经系统造成永久性伤害,甚至危及生命。基因诊断可以进行鉴别诊断,明确疾病预后及对症治疗,避免不必要的肝脏活检。

嘉检消化系统相关遗传病检测基因包

嘉检消化系统优选基因包涵盖临床常见的遗传性肝病、炎症性肠病、胆汁淤积症、先天性腹泻、肝豆状核变性、糖原累积症、消化道异常和Citrin缺乏症等。可同时分析SNV和indel(包括已知致病内含子变异)、拷贝数变异(CNV)、AOH,尤其是新型变异、罕见变异及嵌合变异等。

注:基因包内的所有基因均可以单独检测,并根据患者的临床表型进行调整,且随着医学的发展而有所变化,详情可咨询400-179-2998。

精典病例 - Alagille综合征

患者:女, 2岁
临床病症:
生成长发育倒退,血乳酸升高,颈部和肢体近端肌无力
家族史:
父母无相关临床症状
检测方案:
消化系统优选基因包
检测结果:
Alagille综合征
消化系统优选基因包检测报告
一、检测结论:检测到与临床表现可能相关的罕见变异。
二、检测结果和解读:

检测结果质控统计:这个综合征基因包检测区间包括1,856个相关基因,25,702个编码区总共含4,137,457个碱基。

平均覆盖深度291+/-150X,大于10X覆盖区间占99.8%,大于20X覆盖区间占99.7%。

基因名称 OMIM编号 遗传方式 HG19位置 转录本 基因区 核苷酸与氨基酸改变 合子状态 人群频率 ACMG变异 分类 相关疾病/文献 来源
JAG1 601920 AD chr20:1065xxxx NM_000214 - c.3xxdupA(p.TxxxNfs*38) 杂合 - 2类-可能致病 Alagille综合征 新发
Alagille综合征,主要临床特征:

① 在出生后发生黄疸,肝内胆汁淤积为本病的主要特征;

② 可能伴有胆管缺如,先天性心脏病和特殊面容。

精典病例 - 糖原贮积症

患者:男, 4岁
临床病症:
肝脏大,低血糖,转氨酶高
家族史:
父母无相关临床症状
检测方案:
消化系统优选基因包
检测结果:
糖原贮积症IXa型
消化系统优选基因包检测报告
一、检测结论:检测到与临床表现相关的罕见变异。
二、检测结果和解读:

检测结果质控统计:这个综合征基因包检测区间包括1,856个相关基因,25,702个编码区总共含4,137,457个碱基。

平均覆盖深度275+/-142X,大于10X覆盖区间占99.9%,大于20X覆盖区间占99.8%。

基因名称 OMIM编号 遗传方式 HG19位置 转录本 基因区 核苷酸与氨基酸改变 合子状态 人群频率 ACMG变异 分类 相关疾病/文献 来源
PHKA3 300798 XL chrX:1892xxxx-1892xxxx NM_000292 - 20-21号外显子缺失 x0 - 1类-致病变异 糖原贮积症IXa型 母亲(杂合)
糖原贮积症IXa型,主要临床特征:

① 生长发育迟缓,肝肿大,低血糖,转氨酶轻度升高,胆固醇轻度升高,甘油三酯轻度升高;

② 临床和生化异常可随着年龄的增长而消失。